Основными направлениями деятельности МПЦ являются:
- содействие развитию демократических процессов, построению гражданского общества и правового государства, внедрению и развитию института медиации в Казахстане;
- оказание юридической, психологической и медиативной помощи;
- обучение профессиональных медиаторов, ведение их реестра;
- разработка проектов и программ по вопросам защиты прав человека, развития медиации и снижения уровня конфликтности в обществе; проведение мониторинга и анализа по вопросам соблюдения прав человека;
- расширение и укрепление международных связей по правовым и медиативным вопросам.